Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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