Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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PTPRRQ15256 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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