Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCLAFQ15004 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCLAFQ15004 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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