Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO1Q147U7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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