Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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