Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF235Q14590 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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