Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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