Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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