Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms