Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCINQ13939 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCINQ13939 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCINQ13939 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCINQ13939 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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