Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF2H3Q13889 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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