Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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