Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH18Q13634 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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