Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms