Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEUROD1Q13562 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
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