Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF1Q13351 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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