Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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