Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
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