Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX10Q13206 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX10Q13206 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms