Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF1Q13077 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms