Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXF1Q12946 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXF1Q12946 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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