Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRAF2Q12933 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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