Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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LMAN2Q12907 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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