Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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