Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TROQ12816 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TROQ12816 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TROQ12816 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TROQ12816 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TROQ12816 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TROQ12816 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TROQ12816 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TROQ12816 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TROQ12816 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms