Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP1B1Q10567 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms