Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms