Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC15Q0P6D6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms