Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms