Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4CQ08493 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms