Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFF3Q07654 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms