Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCL9Q07325 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms