Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF11Q05519 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms