Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB1Q02818 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB1Q02818 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms