Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms