Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCNT1Q02742 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms