Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB1Q02641 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL122008.3-201ENST00000412483 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms