Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLCB3Q01970 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms