Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms