Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNC1Q01954 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNC1Q01954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms