Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms