Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1BQ00975 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms