Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK16Q00536 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms