Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms