Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD3P84022 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD3P84022 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD3P84022 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD3P84022 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms