Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCL20P78556 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCL20P78556 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CCL20P78556 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CCL20P78556 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CCL20P78556 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL20P78556 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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