Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HBBP68871 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HBBP68871 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HBBP68871 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBBP68871 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms