Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EEF1A1P68104 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms