Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL3P58872 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms