Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL3P58215 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms